Cours - Quantitative Approaches to DNA Damage and Repair

Cet atelier d'une semaine fait partie d'une série d'écoles d'hivers dites "Winter Schools" organisées par PSL et Qlife, dispensées à l'École normale supérieure (ENS).

Description

Les récentes avancées technologiques en matière de séquençage, d'imagerie et d'analyse d'images ont permis un accès sans précédent aux processus et voies complexes, dynamiques et parfois même chevauchantes que presque tous les organismes utilisent pour réparer leur ADN, garantissant ainsi l'intégrité de leur génome.

Le programme Qlife en Biologie Quantitative de l'université PSL organise une école d'hiver de 5 jours qui abordera ces nouvelles approches à travers une série de conférences et d'ateliers numériques, en utilisant des ensembles de données provenant d'organismes modèles, tant procaryotes qu'eucaryotes.
Les fin d'après-midi seront consacrées à des séminaires animés par des conférenciers de renom et à des Sessions Poster par les étudiants.

L'objectif de cette "Winter School" est de fournir aux participants un ensemble de compétences de base dans différents domaines, notamment l'analyse quantitative des différentes voies de réparation de l'ADN, la compréhension de l'organisation physique supérieure des génomes mais aussi l'étude de l'expression cellulaire. 

La dynamique des processus de réparation de l'ADN sera étudiée à l'aide d'approches d'imagerie allant du suivi en temps réel de molécules individuelles de complexes de réparation à l'analyse à l'échelle cellulaire. L'analyse quantitative des résultats des voies de réparation de l'ADN sera étudiée en superposant les informations séquentielles à une modélisation multi-échelle des marques chromatiques et à la compréhension actuelle de l'organisation physique supérieure des génomes en domaines topologiquement associés. Ces données seront intégrées aux résultats des analyses transcriptomiques spatiales et unicellulaires afin de fournir une vue combinée sans précédent de la localisation, de la morphologie, des interactions, de la migration, du profil d'expression et du devenir des cellules.

Les ateliers traiteront des sujets suivants :

• Apprentissage automatique de la formation et réparation des DSB
• Suivi en temps réel des erreurs de réplication et des mutations au niveau de la cellule unique
• Compréhension de l'organisation chromosomique : physique des polymères et des données HI-C
• Traitement des données BLISS
• Transformation d'images microscopiques en analyses quantitatives robustes et fiables

Keywords

Quantitative analysis, DNA repair, DSB, quantitative biology, HI-C Data, Chromatin, BLISS data, single-cell, photochemistry, transcriptomic... 

_Candidature (date limite au 19 janvier 2026)_

La "Winter School" est limitée à 25 participants (la sélection est compétitive). Elle est ouverte aux étudiants en master 2 et doctorants, ainsi qu'aux post-doctorants, ingénieurs et jeunes chercheurs ayant une formation en chimie, en sciences de la vie, en physique, en informatique et en mathématiques. Des connaissances ou une expérience dans les domaines enseignés par l'école sont recommandées

Une expérience de base dans la manipulation de fichiers sous Unix/Linux et des compétences en codage Python ou R sont également requises.

Frais d'inscription : 150 € pour les participants universitaires (les frais couvrent les déjeuners du lundi au vendredi).

Procédure de candidature :

1) Inscrivez-vous via le lien suivant : https://forms.cloud.microsoft/e/h7Au5vMBmP 
2) De plus, veuillez fournir votre CV, une lettre de motivation et une lettre de recommandation de votre supérieur hiérarchique dans un seul fichier PDF intitulé “Qlife DNA repair WS2026_NOM” à l'adresse suivante : qlife.events@psl.eu